Sú pracovné poradné orgány združenia na čele s predsedami jednotlivých sekcií. Predsedov volia členovia sekcií na základe ich odborných a osobných predpokladov. Zvolení predsedovia musia byť členmi združenia. Za členov sekcií môžu byť kooptovaní aj nečlenovia združenia, ktorí svojou činnosťou môžu prispieť k plneniu jeho cieľov, osobitne zástupcovia verejnej správy.
Sekcie predstavujú súhrn odvetví, inštitúcií, úradov a orgánov, ktoré sú rozhodujúcimi garantmi rozvoja regiónu. Poslaním sekcií je vypracovať a predkladať do rady združenia stanoviská, návrhy a požiadavky súvisiace so špecifikáciou regionálneho rozvoja v príslušnej oblasti svojho pôsobenia. Zasadnutie zvoláva predseda sekcie. Sekcia vzniká spojením minimálne troch členov združenia. Počet sekcií schvaľuje VZ. Rokujú podľa potreby.